Как я делаю многослойную загрузку файла / загрузку файла формы с jax-rs?

Главное - использовать аннотацию @MultipartForm, которая поставляется с RESTEasy. Это позволяет вам определить POJO, содержащее все части формы, и легко связать его.

Возьмем, например, следующее POJO:

public class FileUploadForm {
    private byte[] filedata;

    public FileUploadForm() {}

    public byte[] getFileData() {
        return filedata;
    }

    @FormParam("filedata")
    @PartType("application/octet-stream")
    public void setFileData(final byte[] filedata) {
        this.filedata = filedata;
    }
}

Теперь все, что вам нужно сделать, это использовать это POJO в сущности, которая будет выглядеть примерно так:

@POST
@Path("/upload")
@Consumes("multipart/form-data")
public Response create(@MultipartForm FileUploadForm form) 
{
    // Do something with your filedata here
}