Буферы протокола Google выдерживают сравнение

Ну, буфер протокола - это просто формат сериализации для некоторого типа объекта. Почему бы не использовать буфер протокола для восстановления исходных объектов, а затем позволить этим объектам сравнивать себя, используя любую логику сравнения, которую вы встроили в класс?

Возможно, это не идеальное решение, но я думаю, что это можно сделать с помощью:

messageA.DebugString() == messageB.DebugString();

Кроме этого, я думаю, что единственным решением было бы создать свое собственное Сообщение и реализуйте логический оператор == (const Message &) .