Использование .htaccess с FastCGI

Я читал, что при использовании FastCGI для запуска PHP файл .htaccess включен в основной каталог моего сайта игнорируется (прямо сейчас у меня есть файл .htaccess, расположенный в /var/www/vhosts/mydomain.com/httpdocs). Мой вопрос в том, как я могу применить директивы и флаги в .htaccess только к этому домену. ? Могу ли я иметь httpd.conf только для этого домена? Где мне разместить текущее содержимое .htaccess, чтобы те же настройки работали?

заранее большое спасибо,