Я нашел этот инструмент http://sab39.netreach.com/Software/Japitools/JDK-Results/46/ , который проверяет обратную совместимость между различными версиями API для Java с помощью javadoc.
Есть ли инструмент, эквивалентный этому для C # /. NET?
Вот пример сравнения API JDK 1.5 и JDK 6 с помощью этого инструмента: http://www.kaffe.org/~stuart/japi/htmlout/h-jdk15- jdk6
Я не пробовал инструмент Java, с которым вы связались, но NDepend имеет несколько мощных инструментов для сравнения двух наборов двоичных файлов и выделения никаких отличий.