Добавьте это к началу своего скрипта:
args<-commandArgs(TRUE)
Затем вы можете обратиться к аргументам, переданным как args[1]
, args[2]
и т. д.
Затем запустите
Rscript myscript.R arg1 arg2 arg3
Если ваши аргументы являются строками с пробелами в них, заключите их в двойные кавычки.