Как вы знаете, сколько памяти вам нужно для импорта файла с Logstash?

Я предлагаю использовать Pattern и Matcher, который почти наверняка достигнет того, чего вы хотите. Ваше регулярное выражение должно быть несколько сложнее, чем то, что вы используете в String.split.