Для документирования классов с помощью roxygen(2), указание заголовка и описания/детальных элементов кажется таким же, как и для функций, методов, данных и т.п. Однако слоты и наследование являются их собственным видом. Какова лучшая практика -- текущая или планируемая -- документирования классов S4 в roxygen2?
Due Diligence:
Я нашел упоминание метки @slot
в ранних описаниях роксигена.
Пост списка рассылки R-формы 2008 года.
похоже, указывает на то, что он мертв,
и нет поддержки для @slot
в roxygen:
Это верно для roxygen2? В ранее упомянутом сообщении говорится о том, что пользователь должен вместо этого сделать свой собственный постатейный список с разметкой LaTeX. Например новый класс S4, который расширяет "символ"
, будет закодирован и документирован таким образом:
#' The title for my S4 class that extends \code{"character"} class.
#'
#' Some details about this class and my plans for it in the body.
#'
#' \describe{
#' \item{myslot1}{A logical keeping track of something.}
#'
#' \item{myslot2}{An integer specifying something else.}
#'
#' \item{myslot3}{A data.frame holding some data.}
#' }
#' @name mynewclass-class
#' @rdname mynewclass-class
#' @exportClass mynewclass
setClass("mynewclass",
representation(myslot1="logical",
myslot2="integer",
myslot3="data.frame"),
contains = "character"
)
Однако, несмотря на то, что это работает, этот \describe
, \item
подход к документированию слотов кажется несовместимым с остальной частью roxygen(2), в том, что нет @
-ограниченные метки и слоты могут остаться незадокументированными без возражений со стороны roxygenize()
. Это также ничего не говорит о последовательном способе документирования наследования определяемого класса. Я полагаю, что зависимость все еще работает нормально (если определенный слот требует небазовый класс из другого пакета), используя тег @import
.
Итак, подведем итог, каков в настоящее время лучший опыт работы со слотами roxygen(2)?
На данный момент, похоже, есть три варианта для рассмотрения:
- A -- Itemized list (как, например, выше).
- B --
@слот
... но с дополнительными тегами/внедрением я пропустил. Я не смог получить @слот для работы с roxygen / roxygen2 в версиях, где он был включен в качестве замены постатейного перечня в примере наверху. Опять же, вышеприведенный пример работает с кислородом(2).- C -- Какой-то альтернативный тег для указания слотов, например
@param
, который выполнил бы то же самое.
Я заимствую/расширяю этот вопрос из сообщения, которое я сделал на странице разработки roxygen2
на github.