Учтите, что согласно ссылка :
Не храните логику приложения в базе данных. Существуют ограничения производительности для работы JavaScript внутри MongoDB. Код приложения также наиболее эффективен, когда он совместно использует управление версиями с самим приложением.
Таким образом, в mongodb нет эквивалента для хранимой процедуры.