Если кто-то снова столкнется с этой проблемой по отношению к EJB TimerTask - как я и сделал - вот подсказка, если вы используете WebSphere Application Server:
Есть 2 командных файла / сценарии оболочки в папке bin файла, которая может отображать и удалять задачи таймера EJB. В моем случае у меня были некоторые задачи таймера, которые сериализовали объекты с другим устаревшим serialVersionUID. Я не мог избавиться от них, поскольку сериализованные объекты действительно изменились. Поэтому я просто использовал те:
findEJBTimers.bat cancelEJBTimers.bat
Ваши задачи таймера исчезли, а также сообщения об ошибках. В моем случае это было именно то, что мне было нужно, но было сложно получить эту информацию.