Я не думаю, что это действительно возможно, нет. Тот же экземпляр интерпретатора должен обрабатывать каждый модуль, импортированный в данном приложении, поэтому нет очевидного способа смешивания и сопоставления интерпретаторов. Если вам нужно выполнить дискретную задачу с помощью модуля Python 3, вы можете попробовать создать сценарий командной строки для выполнения своей задачи, а затем вызвать этот сценарий в качестве подпроцесса из вашего приложения Python 2, но это было бы неудобно сказать меньше .
Обратите внимание, что я не думаю, что на самом деле есть очень много модулей Python 3-only. Большинство модулей в этот момент поддерживают либо версии, либо только Python 2.