У W3C есть API:
http://jigsaw.w3.org/css-validator /api.html
Вы также можете загрузить валидатор и запустить его локально: http://jigsaw.w3.org/css-validator/DOWNLOAD.html
У вас должна быть возможность запускать java из вашего скрипта.
Библиотека Python:
http://cthedot.de/cssutils/