Модель обнаружения объекта Tensorflow quick_rcnn inception_resnet_v2 atrous_oid.config показывает следующую проблему?

Функция для этого - aperm, из базового пакета. Это обобщение функции транспонирования t() на многомерные массивы. Для вашего примера вы бы назвали его следующим:

new.data <- aperm(old.data, c(2,3,1))