Это приведет к удалению нескольких твитов в одном запросе, просто передайте массив в $ in: -
db.clusters.update({},
{$pull: {members: {$in: [ {tweetID: '5327010328645530500'},{"tweetID" : "2820402625046999289"} ] } } },
{multi: true})
Вышеуказанный метод не работает в mongoose, поэтому для mongoose do: -
db.clusters.update ({}, {$ pull: {members: [{tweetID: '5327010328645530500'}, {"tweetID": "2820402625046999289"}]}}),
Вам нужно установить numberOfLines
в ненулевое число, чтобы он работал.