Когда скорость CAReplicatorLayer равна 0, эффект копирования исчезает

Вы были очень близки и по существу имели это. Формальная ссылка из «Написание R-расширений»:

1.1.3 Пакеты подкаталогов

[...]

Содержимое inst будет скопирован рекурсивно в каталог установки. Подкаталоги inst не должны мешать тем, которые используются R (в настоящее время, R, data, demo, exec, libs, man, help, html и Meta, а более ранние версии - latex, R-ex). Копирование inst происходит после создания src, поэтому его Makefile может создавать файлы, которые будут установлены. До R 2.12.2 файлы были установлены на платформах POSIX с разрешениями в источниках пакетов, поэтому следует проявлять осторожность, чтобы они не были слишком строгими: R CMD build выполнит соответствующие настройки. Чтобы исключить установленные файлы, можно указать список шаблонов исключений в файле .Rinstignore в исходном каталоге верхнего уровня. Эти шаблоны должны быть регулярными выражениями, подобными Perl (см. Справку для regexp в R для точных деталей), по одной в каждой строке, для соответствия (10) по пути файла и каталога, например. doc/.*[.]png$ исключает все PNG-файлы в inst/doc на основе расширения (нижнего регистра).