hbase скрипт сторожевого сервера

Это не поддерживается. В принципе, вы можете работать с файлом jar, но нет гарантии, что новое содержимое будет правильно загружено. Пусть ваши инструменты сборки управляют файлом jar - и выберите что-то еще для постоянной памяти, управляемой вашей программой. Как файл.