Сравнение сгенерированных исполняемых файлов для equivilance

Я должен сравнить 2 исполняемых файла и/или общие объекты, скомпилированное использование того же компилятора/флагов и проверить, что они не изменились. Мы работаем в отрегулированной среде, таким образом, было бы действительно полезно для тестирования изолировать точно, какие части исполняемого файла изменил.

Используя MD5Sums/Hashes не работает из-за заголовков, содержащих информацию о файле.

Кто-либо знает о программе или способе проверить, что 2 файла являются executionally тем же, даже если они были созданы в другое время?