С UNION MySQL результаты в PHP будут зависеть от первых выбранных столбцов

Вы можете использовать babel для разбора десятичных знаков в локальных форматах:

>>> parse_decimal('1,099.98', locale='en_US')
Decimal('1099.98')
>>> parse_decimal('1.099,98', locale='de')
Decimal('1099.98')