как я могу изменить частоту CPU вручную с помощью sysfs и подсистему CPUFREQ?

Согласно этому:

Если вы используете userspace governor, вы можете написать в /sys/devices/system/cpu/cpu0/cpufreq/scaling_setspeed, чтобы изменить текущую скорость.

# echo 700000 > /sys/devices/system/cpu/cpu0/cpufreq/scaling_setspeed 
# cat /proc/cpuinfo 
cpu MHz  : 697.252 
# echo 900000 > /sys/devices/system/cpu/cpu0/cpufreq/scaling_setspeed 
# cat /proc/cpuinfo 
cpu MHz  : 976.152 

Для включения регулятора пространства пользователей необходимо записать userspace в /sys/devices/system/cpu/cpu0/cpufreq/scaling_governor:

# echo userspace > /sys/devices/system/cpu/cpu0/cpufreq/scaling_governor