Вам не нужно использовать метод getTime - вы можете вычесть объект даты из другого объекта даты. Он будет возвращать разницу в миллисекундах (отрицательная, если вторая - более поздняя дата)
var startDate1 = new Date("02/10/2012");
var startDate2 = new Date("01/10/2012");
var diff= (startDate1 -startDate2)
// оценивается в 0, если даты имеют одинаковую метку времени