Как добавить строку в файл через CMD после указанной строки?

Было бы гораздо проще использовать пользовательские компараторы:

Сортировка по name:

Arrays.sort(carArray, Comparator.comparing(Car::name));

Сортировка по colour:

Arrays.sort(carArray, Comparator.comparing(Car::colour));

Итак, вы можете изменить getSortedArray():

public static Car[] getSortedArray(Car[] carArray, Comparator<Car> comparator) {
    Car[] sorted = carArray.clone()
    Arrays.sort(sorted, comparator);
    return sorted;
}

И называть его следующим образом:

Car[] sorted = getSortedArray(carArray, Comparator.comparing(Car::name));

Изменить:

Если вы используете языковая версия, которая не поддерживает эти функции, вы можете создавать компараторы, явно создавая вложенный класс, реализующий интерфейс Comparator.

Это, например, одноэлемент Comparator, который сравнивает Car экземплярами name:

static enum ByName implements Comparator<Car> {
    INSTANCE;

    @Override
    public int compare(Car c1, Car c2) {
        return c1.name().compareTo(c2.name());
    }
}

Затем вызывать:

Car[] sorted = getSortedArray(carArray, ByName.INSTANCE);