Документ не сохранен после импорта контента

Вы не можете назначить непосредственно массив после его объявления. В основном ваш код такой же, как

int main()
{
    double arr[2][2];
    arr = { {1, 2}, {3, 4.5} }; // error
}

. Вы должны либо присвоить значение в объявлении

double arr[2][2] = { {1, 2}, {3, 4.5} };

, либо использовать цикл (или std::copy) для назначения элементов. Поскольку ваш массив представляется переменной-членом, вы также можете инициализировать его в списке инициализации конструктора:

 mcmc_dhs() : data(), cosmohandler(0.3,0.7,0.21,0.8,0.04), 
              lenseff(), intrvar(), 
              boundaries{{0,512},{0,512},{0.01,5.},{100.,3000.},{0.1,50}}
 { 
    // rest of ctor implementation
 }