Не могу записать данные, извлеченные из файла DICOM в файл CSV
Это связано с тем, что ваши относительные URI имеют свою базу. Первоначально база /, когда страница /swift-details.php?id=foo, и браузер правильно заполняет относительные ссылки с базой /. Но когда браузер переходит на страницу типа /swift/details/foo, база внезапно становится /swift/, и она пытается добавить это перед всеми относительными URL-адресами и, следовательно, ни один из них не загружается.
Вы можете либо сделать свой ссылки абсолютны или изменить базу URI в заголовке ваших страниц (в промежутке между тегами <head> </head>):
<base href="/">
1 ответ
Предполагая, что оператор «break» в вашем цикле for означает, что вам нужна информация только о первом изображении, попробуйте:
import pydicom
import os
import csv
data_dir = 'C:\\Users\\dmgop\\Personal\\TE Project-Pneumonia\\stage_1_test_images_dicom'
patients = os.listdir(data_dir)
with open('file.csv','w') as myfile:
writer = csv.writer(myFile)
# patients[0] means get the first filename, no need for the for loop
lung = pydicom.dcmread(os.path.join(data_dir, patients[0]))
print(lung.formatted_lines)
# pay attention to the function_call --> formatted_lines()
writer.writerows(lung.formatted_lines())
Посмотрите документы Pydicom для FileDataset который является типом возврата для метода dcmread.
Если вы хотите записать данные для всех файлов в каталоге, попробуйте следующее:
import pydicom
import os
import csv
data_dir = 'C:\\Users\\dmgop\\Personal\\TE Project-Pneumonia\\stage_1_test_images_dicom'
patients = os.listdir(data_dir)
with open('file.csv','w') as myfile:
writer = csv.writer(myfile)
for patient in patients:
if patient.lower().endswith('.dcm'):
lung = pd.dcmread(os.path.join(data_dir, patient))
writer.writerows(lung.formatted_lines())
Также взгляните на последнюю часть этого параграфа об использовании 'with open () как '