Если удаленный репозиторий не пуст (это так, если вы используете IBM DevOps на hub.jazz.net), вам необходимо использовать следующую последовательность:
cd <localDir>
git init
git add -A .
git pull <url> master
git commit -m "message"
git remote add origin <url>
git push
EDIT 30th 17 января: см. Комментарии ниже, убедитесь, что вы находитесь на правильном репо!