Не уверен насчет формата результата Get-ChildItem

Вы можете использовать ниже -

SET @qry = CONCAT('SELECT ',@SHIFTIME,' INTO @SHIFTSELECT FROM `oee_machinenames` where `oee_machinenames`.`ID` = New.NAME');
PREPARE stmt FROM @qry;
EXECUTE stmt;
DEALLOCATE PREPARE stmt;