Я не могу заставить scipy функционировать в режиме на 32 бита при компиляции как i386/x86_64 универсальный двоичный файл и казни на моих 64 битах 10.6.2 MacPro1,1.
С помощью этого ответа я создал Intel на 32/64 бита универсальный двоичный файл Python 2.6.4 с намерением использовать arch
управляйте для выбора между архитектурой. (Мне удалось сделать некоторые универсальные двоичные файлы нескольких библиотек, я хотел использовать lipo.), Что все работы. Я затем установил scipy согласно инструкциям относительно статьи hyperjeff, только с более актуальным numpy (1.4.0) и пропуском бита о перемещении numpy в стороне кратко во время установки scipy.
Теперь, все кроме scipy, кажется, работает насколько я могу сказать, и я могу действительно выбрать между использованием режима на 32 и 64 бита arch -i386 python
и arch -x86_64 python
.
Scipy жалуется в режиме на 32 бита:
$ arch -x86_64 python -c "import scipy.interpolate; print 'success'"
success
$ arch -i386 python -c "import scipy.interpolate; print 'success'"
Traceback (most recent call last):
File "", line 1, in
File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/interpolate/__init__.py", line 7, in
from interpolate import *
File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/interpolate/interpolate.py", line 13, in
import scipy.special as spec
File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/__init__.py", line 8, in
from basic import *
File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/basic.py", line 8, in
from _cephes import *
ImportError: dlopen(/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/_cephes.so, 2): Symbol not found: _aswfa_
Referenced from: /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/_cephes.so
Expected in: flat namespace
in /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/_cephes.so
Похоже, что scipy.interpolate импортирует что-то позвонившее _cephes
, который ищет названный символ _aswfa_
но не может найти его в режиме на 32 бита. Просматривая источник scipy, я нахожу ASWFA
подпрограмма в specfun.f. Единственный scipy файл продукта с аналогичным именем является specfun.so, но и это и _cephes.so, кажется, универсальные двоичные файлы:
$ cd /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/
$ file _cephes.so specfun.so
_cephes.so: Mach-O universal binary with 2 architectures
_cephes.so (for architecture i386): Mach-O bundle i386
_cephes.so (for architecture x86_64): Mach-O 64-bit bundle x86_64
specfun.so: Mach-O universal binary with 2 architectures
specfun.so (for architecture i386): Mach-O bundle i386
specfun.so (for architecture x86_64): Mach-O 64-bit bundle x86_64
Гул Ho. Я застреваю. Вещи я могу попробовать, но не выяснил, как все же включают компиляцию specfun.so сам вручную, так или иначе.
Я предположил бы, что scipy не повреждается для всех машин на 32 бита, таким образом, я предполагаю, что что-то неправильно со способом, которым я установил его, но я не могу выяснить что.
Я действительно не ожидаю полный ответ, учитывая свою довольно уникальную (?) установку, но если у кого-либо будут какие-либо подсказки, которые могли бы указать на меня в правильном направлении, то они будут значительно цениться.
Я использую gfortran (GNU Фортран от GCC 4.2.1 сборки Apple Inc. 5646).
Python 2.6.4 был установлен более или менее как так:
cd /tmp
curl -O http://www.python.org/ftp/python/2.6.4/Python-2.6.4.tar.bz2
tar xf Python-2.6.4.tar.bz2
cd Python-2.6.4
# Now replace buggy pythonw.c file with one that supports the "arch" command:
curl http://bugs.python.org/file14949/pythonw.c | sed s/2.7/2.6/ > Mac/Tools/pythonw.c
./configure --enable-framework=/Library/Frameworks --enable-universalsdk=/ --with-universal-archs=intel
make -j4
sudo make frameworkinstall
Scipy 0.7.1 был установлен в значительной степени, как описано как здесь, но он сводится к простому sudo python setup.py install
.
Действительно казалось бы, что символ не определен в i386 архитектуре при рассмотрении _cephes библиотеки с nm
, как предложил David Cournapeau:
$ nm -arch x86_64 /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/_cephes.so | grep _aswfa_
00000000000d4950 T _aswfa_
000000000011e4b0 d _oblate_aswfa_data
000000000011e510 d _oblate_aswfa_nocv_data
(snip)
$ nm -arch i386 /Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.6/lib/python2.6/site-packages/scipy/special/_cephes.so | grep _aswfa_
U _aswfa_
0002e96c d _oblate_aswfa_data
0002e99c d _oblate_aswfa_nocv_data
(snip)
однако, я еще не могу объяснить его отсутствие.
Как вы устанавливали scipy, для какой версии Python и с каким компилятором fortran?
Вы также можете проверить, действительно ли отсутствует символ в обеих дугах (я не помню, где находится эта функция, но вы сможете довольно легко найти ti самостоятельно, используя комбинацию nm / otool).
Вы пробовали использовать scipy, скомпилированный с использованием macports?
sudo port install scipy +universal
(конечно, у вас должна быть остальная часть цепочки, python
, py26-numpy
, скомпилированная с тем же параметром)
Я получаю:
$ arch -x86_64 /opt/local/bin/python -c "import scipy.interpolate; print 'success'"
success
$ arch -i386 /opt/local/bin/python -c "import scipy.interpolate; print 'success'"
success
затем вы можете использовать настройки и знания, которые разработчики macports использовали для создания вашей собственной компиляции.