Параметр конфигурации protectedSource является предпочтительным параметром для этого.

{Array} CKEDITOR.config.protectedSource

Список регулярных выражений, которые должны выполняться во входном HTML, с указанием кода, который должен оставаться нетронутым.

Я не специалист по регулярным выражениям, но что-то вроде этого должно помочь:

config.protectedSource.push(/[^<]*(<h1>([^<]+)<\/h1>)/g);

вам, возможно, придется немного поэкспериментировать. Предостережение: регулярное выражение в этой форме будет улавливать только теги

...

... .

В config.js используйте следующий код, чтобы определить, какие элементы вы хотите разрешить в CKEditor (я удалил h1):

config.format_tags = 'p;h2;h3;h4;h5;h6;pre;address;div'