Используйте следующий скрипт для получения результата как единого ассоциативного массива, который содержит все идентификаторы
$sql = "SELECT group_concat(userid separator ',') as id FROM `users`";
$query = $this->db->query($sql);
$array1 = $query->row_array();
$arr = explode(',',$array1['id']);
print_r($arr);