Повышение безопасности PHP путем хранения включаемых файлов вне общей папки?

Такие языки, как Perl, Pythong и т.д., обычно считаются более безопасными по сравнению с PHP. Помимо возможных дыр в безопасности, одной из причин может быть (я не знаю, я спрашиваю) то, что мы не помещаем исполняемые файлы Perl и Python в общую папку. Поскольку файлы PHP не являются исполняемыми, безопасно хранить их в общей папке.

Является ли мудрым и практичным подходом хранить php файлы вне общей папки, чтобы ограничить возможный доступ злоумышленников? Если да, то распространен ли он? Потому что я не вижу никаких недостатков (кроме немного более сложной обработки файлов, разбросанных по разным местам); но если это полезно для повышения безопасности, то это стоит рассмотреть. Поскольку я не знаю о способах, которыми хакеры взламывают php-сайты, я не представляю, как это может улучшить безопасность.