Мое приложение подключается к серверу, и на основе файла cookie сервер выдаст другой ответ.
Невозможно программно очистить хранилище файлов cookie, чтобы сервер не распознал мое приложение при следующем обращении к серверу.
Я понял, что очистка файлов cookie в приложении Settings.app применяется только к файлам cookie в Safari.
Большое спасибо за ваш комментарий.