Дилемма механизма хранения MySQL

Есть две функции базы данных MySQL, которые я хочу использовать в своем приложении. Первый - ПОЛНЫЙ ТЕКСТ-ПОИСК и ОПЕРАЦИИ.

Теперь дилемма заключается в том, что я не могу получить эту функцию в одном механизме хранения. Либо я использую MyIsam (который имеет функцию FULL-TEXT-SEARCH), либо я использую InnoDB (который поддерживает функцию TRANSACTION). Я не могу получить и то, и другое.

У меня вопрос, могу ли я использовать обе функции в своем приложении, прежде чем мне придется делать выбор между двумя механизмами хранения.