z-index, кажется, выигрывает на элементе, который идет после анимированного элемента с scaleX

Вы можете использовать метод ajaxSubmit следующим образом :), когда вы выбираете файл, который нужно загрузить на сервер, форма должна быть отправлена ​​на сервер:)

$(document).ready(function () {
    var options = {
    target: '#output',   // target element(s) to be updated with server response
    timeout: 30000,
    error: function (jqXHR, textStatus) {
            $('#output').html('have any error');
            return false;
        }
    },
    success: afterSuccess,  // post-submit callback
    resetForm: true
            // reset the form after successful submit
};

$('#idOfInputFile').on('change', function () {
    $('#idOfForm').ajaxSubmit(options);
    // always return false to prevent standard browser submit and page navigation
    return false;
});
});