В моем случае на OS X 10.8 и PyCharm 3, IDE автоматически выбирала разные установки Python. Я заметил это в Eclipse Pydev, который поднял один правый и работал, как ожидалось. Было нелегко заметить разницу между ними: /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin/python /opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin/python