Как отфильтровать массив с несколькими параметрами

Я бы предложил создать класс утилиты:

public class MutableHolder<T>
{
    public T Value;
    public MutableHolder(T value)
    {
        this.Value = value;
    }
}

Затем сохраните вновь созданный MutableHolder<MapTile> в каждом слоте словаря, а не сразу сохраните MapTile. Это позволит вам легко обновить фрагмент карты, связанный с каким-либо конкретным ключом, без необходимости изменять сам словарь (действие, которое в противном случае, как минимум, аннулирует счетчик, используемый вашим циклом foreach).