R - Использование rvest, когда html end tag находится в неправильном месте

Если вы на самом деле не предназначались для root для вашего репо, это звучит так, будто вы случайно запускали команду Git как root (возможно, даже начальный клон / init). Если вы хотели это сделать, вам придется жить с запуском всех команд Git в репо с правами root. Если вы этого не сделали, запустите sudo chown your-user[:your-group] -R .git, чтобы взять на себя ответственность за это, а затем посмотреть, все ли работает.