Как я уже говорил ранее в Клонирование git repo вызывает ошибку - проверка ключа хоста завершилась неудачно. fatal: удаленный конец неожиданно повесился , добавьте GitHub в список авторизованных хостов:
ssh-keyscan -t rsa github.com >> ~/.ssh/known_hosts