Как решить 4058 нет такого файла или каталога для Firebase Cloud Function?

Почему бы не использовать drop_duplicates из панд:

>>> timeit pd.DataFrame(image.reshape(-1,3)).drop_duplicates().values
1 loops, best of 3: 3.08 s per loop

>>> timeit np.vstack({tuple(r) for r in image.reshape(-1,3)})
1 loops, best of 3: 51 s per loop