perl сравнение элементов массивов и группировка

Я вернулся с другим вопросом. У меня есть список данных:

1 L DIELTQSPE H EVQLQESDAELVKPGASVKISCKASGYTFTDHE
2 L DIVLTQSPRVT H EVQLQQSGAELVKPGASIKDTY
3 A ALQLTQSPSSLSAS B RITLKESGPPLVKPTCS C ELDKWAN
4 A ALQLTQSPSSLSAS B RITLKESGPPLVKPTCS C ELDKWAG
5 A ALQLTQSPSSLSAS B RITLKESGPPLVKPTCS C LELDKWASL
6 L DIQMTQIPSSLSASLSIC H EVQLQQSGVEVKMSCKASGYTFTS
7 L SYELTQPPSVSVSPGSIT H QVQLVQSAKGSGYSFS P YNKRKAFYTTKNIIG
8 L SYELTQPPSVSVSPGRIT H EVQLVQSGAASGYSFS P NNTRKAFYATGDIIG
9 A MPIMGSSVAVLAIL B DIVMTQSPTVTI C EVQLQQSGRGP
10 A MPIMGSSVVLAIL B DIVMTQSPTVTI C EVQLQQSGRGP
11 L DVVMTQTPLQ H EVKLDESVTVTSSTWPSQSITCNVAHPASSTKVDKKIE
12 A DIVMTQSPDAQYYSTPYSFGQGTKLEIKR

И я хотел бы сравнить 3-й элемент && 5-й элемент каждой строки, а затем сгруппировать их, если они имеют одинаковый 3-й && 5-й элемент. Например, для приведенных выше данных результаты будут такими:

3: 3 A ALQLTQSPSSLSAS B RITLKESGPPLVKPTCS C ELDKWAN
   4 A ALQLTQSPSSLSAS B RITLKESGPPLVKPTCS C ELDKWAG
   5 A ALQLTQSPSSLSAS B RITLKESGPPLVKPTCS C LELDKWASL
9: 9 A MPIMGSSVAVLAIL B DIVMTQSPTVTI C EVQLQQSGRGP
   10 A MPIMGSSVVLAIL B DIVMTQSPTVTI C EVQLQQSGRGP

К вашему сведению, в фактических данных 3-й, 5-й, 7-й элементы очень длинные. Я обрезал их, чтобы увидеть целиком.

Вот что я сделал, я знаю, что это очень неуклюже, но, как новичок, я стараюсь изо всех сил. И проблема в том, что он показывает только первый набор «той же» группы. Не могли бы вы показать мне, где что-то пошло не так, и/или другие красивые способы решить эту проблему, пожалуйста?

my $file = <>;
open(IN, $file)|| die "no $file: $!\n";
my @arr;
while (my $line=<IN>){
        push @arr, [split (/\s+/, $line)] ;
}
close IN;

my (@temp1, @temp2,%hash1);
for (my $i=0;$i<=$#arr ;$i++) {
    push @temp1, [$arr[$i][2], $arr[$i][4]]; 
    for (my $j=$i+1;$j<=$#arr ;$j++) {
        push @temp2, [$arr[$j][2], $arr[$j][4]];
        if (($temp1[$i][0] eq $temp2[$j][0])&& ($temp1[$i][1] eq $temp2[$j][1])) {
            push @{$hash1{$arr[$i][0]}}, $arr[$i], $arr[$j];
        }
    }
}
print Dumper \%hash1;