Python / Kivy - Изменение размера окна / Изменение размера приводит к сбою приложения (перестало работать)

Вам нужно добавить

#container
{
    display:inline-block;
    position:relative;
    background:rgb(255,100,0);
    margin:0px;
    width:40%;
    height:100px;
    margin-right:-4px;
}

, потому что всякий раз, когда вы пишете display:inline-block, требуется дополнительный margin-right:4px. Итак, вам нужно удалить его.