Как конвертировать R Markdown в PDF?

Ранее я спрашивал о командах для преобразования R Markdown в HTML.

Как правильно преобразовать файлы R Markdown в документы PDF?

Хорошим решением будет сохранение как можно большей части контента (например, изображений, уравнений, html-таблиц и т. д.). Решение должно быть запущено из командной строки. Хорошим решением также было бы кросс-платформенность и в идеале минимизация зависимостей, чтобы упростить совместное использование make-файлов и т. д.

В частности, существует множество вариантов:

• Преобразовывать ли RMD в MD в HTML в PDF; или RMD в MD в PDF; или RMD to PDF
• При использовании пакета markdownв R, какие параметры указать
• Использовать ли pandoc, пакет, встроенный в R, или что-то еще

Вот пример rmd-файла, который предположительно обеспечивает разумную проверку любого предлагаемого решения. Он был использован в качестве основы для этой записи в блоге.