В новейшей версии ADT (версия 20, превью 3) говорится, что можно сделать так, чтобы файл манифеста библиотек можно было объединять с проектами, которые их используют. :
Автоматическое слияние файлов манифеста проекта библиотеки с манифест проекта. Включите с помощью свойства manifestmerger.enabled.
Как и где его использовать? Я нигде не вижу помощника по контенту, помогающего мне в этом.