Как связаны OnModelCreating и неавтоматические миграции?

Когда я добавляю новую таблицу, которая имеет некоторые отношения к моей базе данных, а затем запускаю Add-Migration, я вижу, что код генерируется в Upдля добавления таблицы и ее связей. Тем не менее, я предпочитаю определять отношение, используя свободный API в методе OnModelCreating. Как эти два метода взаимодействуют? Могу ли я удалить код из метода Up, который определяет отношение, например?