Я думаю, вам придется вручную удалить первую пустую строку. Простой способ сделать это -
String string, subString;
int index;
String[] test;
string = "/Test/Stuff";
index = string.indexOf("/");
subString = string.substring(index+1);
test = subString.split("/");
Это исключает ведущую пустую строку.