Я бы предложил добавить модульные тесты файлов проекта, чтобы убедиться, что ссылки там нет. В зависимости от того, как отличается от имени сборки, это может быть так же просто, как проверить, содержит ли файл это имя, или вам может понадобиться регулярное выражение.
Тест может быть назван соответствующим образом, так что в случае его неудачи разработчик может быть соответствующим образом просвещен, даже не спрашивая, в чем проблема.
Я предполагаю, что у вас есть модульные тесты, которые регулярно запускаются (например, как часть автоматизированной сборки), так что при нарушении теста проблема будет выделена из-за поломки сборки.