Чтобы решить проблему, выполните следующие действия:
Сначала удалите numpy
sudo pip unintsall numpy
Установите numpy с параметром - no-cache-dir
sudo pip install --no-cache-dir numpy
И указать какую-либо конкретную версию, например 1.14.2
sudo pip install --no-cache-dir numpy==1.14.2