Как сделать так, чтобы CMake показывал заголовки - которые не являются частью какой-либо двоичной цели - в IDE?

Существует расширение фильтра ( howto-link , manual ), что очень хорошо работает со всеми переменными GPC. Это не волшебное дело, но вам все равно придется его использовать.