Убедитесь, что соотношение строк и высоты для всех элементов, которые вы пытаетесь выровнять, тоже самое. Если вы используете сочетание меток DIV, P, H1-5, DT, DD, INPUT, BUTTON, это также приведет к нарушениям вертикального выравнивания в зависимости от того, что вы уже определили в другом месте.