Вот решение с jQuery, которое работает как шарм. Он проверяет, больше ли высота окна больше высоты тела. Если это так, то он меняет верхний край нижнего колонтитула для компенсации. Тестирование в Firefox, Chrome, Safari и Opera.
$( function () {
var height_diff = $( window ).height() - $( 'body' ).height();
if ( height_diff > 0 ) {
$( '#footer' ).css( 'margin-top', height_diff );
}
});
Если ваш нижний колонтитул уже имеет верхний край (например, 50 пикселей), вам нужно будет изменить последнюю часть для:
css( 'margin-top', height_diff + 50 )