CodeIgniter удаляет index.php из URL

Спецификация ограничивает вывод параметра типа для общих методов ко всем или ничто. Вы не можете иметь частичный вывод.

Обоснование, вероятно, упрощает правила вывода типов (которые уже довольно сложны, так как они также должны учитывать правила перегрузки).