Сбой Excel в строке VLOOKUP

Используйте конструктор, который принимает File и boolean

FileOutputStream(File file, boolean append) 

и устанавливает логическое значение в true. Таким образом, данные, которые вы пишете, будут добавляться в конец файла, а не перезаписывать то, что уже было там.