Что означает в аргументах ошибки & ldquo; разное количество строк: x, y & rdquo; имею в виду?

Apache Maven плюс плагин shade будет делать именно то, что вам нужно.

Проверьте «Shade Plugin», где добавлен Main-Class раздел MANIFEST.MF "здесь http://maven.apache.org/plugins/maven-shade-plugin/examples.html